【聯邦軍第二篇：阿修塔羅斯】
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由於「白色獵犬隊」的準確判斷，聯邦軍成功佔領了愛麗絲泉，而原先以攻略愛麗絲泉作為首要目標的第一主力部隊「紅色袋貂」，在留下最低限度的兵力充作戒備後，隨即兵分二路，各自支援北部的「綠色針鼴」與南部的「黃色矮袋鼠」，而白色獵犬隊因為無血奪還愛麗絲泉的功績，特別准許停留在愛麗絲泉休息待命。
在這段期間，位於北美戰線的聯邦軍傳來捷報。
0079年12月15日，吉翁軍於地球最後的據點「加利福尼亞基地」成功被聯邦軍攻陷。
聯邦軍接著在各地擊退敗逃的吉翁軍，而澳洲戰線也充斥著勝利的氛圍，負責攻略南部的黃色矮袋鼠也順利收復了「阿得雷德」，因此白色獵犬隊便再度出發，隨紅色袋貂分隊會合，一口氣支援進攻南部地帶。
過程中，司令部送來了一架RX-77D(量產型鋼加農)配給至先前立下戰功的白色獵犬隊，本作擔任主角的隊長「馬斯特•P•雷爾 」將這架MS交由擅長砲擊支援的隊員「麥斯米蘭•柏格」(以下簡稱麥克)駕駛，小隊的下個任務便是持續攻略位於南方東岸的城市「墨爾本」。
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麥克駕駛本機在墨爾本充分發揮了實力，很順利地掃討了當地的吉翁軍。
在激戰後白色獵犬隊隊員「梁•理斐」表示懷疑敵方潛艦與逃亡的直昇機似乎在運送著什麼，因此建議請求調查隊協助調查，於是馬斯特讓梁暫時脫隊協助調查隊的搜。
但事實上梁的另一身分是「賈布羅基地」派遣的「聯邦諜報部成員」，被安排至白色獵犬隊的目的，最初是方便監視澳大利亞「特靈頓基地」的核武設施，但後來根據上級情報指出吉翁軍似乎正秘密運送一種危險的武器從加利福尼亞基地逃走，因此梁打從故事初期，就不斷以暗示的方式引導隊長馬斯特朝追蹤「環境破壞兵器」的下落在行動，而在這之前知道梁真實身份的只有司令官「史坦利•霍金斯」上校。
不久後，在墨爾本協助調查隊的調查結果發現，小隊掃討的潛水艦確定是先前從加利福尼亞基地逃脫的吉翁軍部隊，而在其中正裝載著一種大規模環境破壞兵器「阿修塔羅斯(アスタロス)」。
阿修塔羅斯，原本是過去為了解決宇宙殖民地內農作物難以栽種以及供給不足的問題而開發出來的病毒，對人體無害，僅會寄生於植物，具有能夠促進宿主成長的作用，本來僅研究用於像殖民地一樣的閉鎖空間內栽種使用，若是將其用於地球上則會發生毀滅性的後果。
這些寄生種會過度刺激其他植物生長並且快速擴散覆蓋所有環境，只需幾年就會嚴重破壞生態平衡，其間接造成的大規模生態系破壞將會使地球滅亡，因此這項危險的研究案最初被聯邦凍結。
而戰爭爆發後，吉翁軍科學家在加利福尼亞基地再次啟動研究案，但透過研究明白阿修塔羅斯可怕的性質，最終本該在基地淪陷前連同樣品跟資料一起銷毀，但意圖作為戰爭最終手段使用的「基西莉亞•薩比」，其直屬的特殊部隊「熊魔靈隊」為了隱瞞這個秘密，在逃離基地前殺光了所有科學家並帶走了樣本與資料，並將該品種的樣本複製交由數個支隊秘密運輸。
目前已從先前墨爾本作戰中擊潰的吉翁軍隊殘骸發現一部分的複製品，於是史坦利上校，私下向白色獵犬隊的隊長馬斯特說明了他們正在追蹤從加利福尼亞基地搭乘潛水艦逃亡的吉翁軍，盡可能的調查其他仍在外流通的複製品，因此將派遣白色獵犬隊前往「布羅肯希爾」追擊逃亡的熊魔靈隊，阻止阿修塔羅斯的流通。
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從墨爾本出發，馬斯特緊接著率小隊快速的拿下布羅肯希爾採礦場，但卻沒發現熊魔靈隊的蹤跡，史坦利上校隨即傳來指示，布羅肯希爾的吉翁軍可能是誘餌，而真正的熊魔靈隊可能是稍早前攻擊「特靈頓基地」的德姆部隊，因為澳洲吉翁軍並沒有投入MS-09B(德姆)作為部隊兵力，所以擁有德姆的吉翁軍肯定是來自加利福尼亞的敗逃軍，但馬斯特不解為何他們要攻擊戰略價值極低的特靈頓基地，於是史坦利上校便透露，其實特靈頓基地並不是什麼後方支援基地，而是聯邦違反南極條約秘密封存核武的儲藏設施，為的就是怕吉翁軍意圖違反條約使用核武時用以反制嚇阻的目的，另外核武之所以選擇特靈頓這樣小規模人員稀少的基地存放，是為了避人耳目，而平時特靈頓基地若受到攻擊，鄰近的「查爾維爾基地」會出兵前往防衛，但目前查爾維爾基地自己也遭到吉翁軍的攻擊，因此無法即時救援，而白色獵犬隊下一個任務便是緊急支援特靈頓基地，同時拿下熊魔靈隊。
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在航行途中，小隊通訊員「亞妮妲•朱利安」便質問梁為何先前似乎就已經知道熊魔靈隊、核武這些事情，梁眼看即將被拆穿，便向全員坦白自己的真實身份其實是直屬「賈布羅總司令部」的諜報員，最初任務是保護並監視特靈頓基地的核武，希望小隊能原諒他先前隱瞞秘密，其他人瞭解來由後不僅沒有怪罪梁，甚至反而使小隊間的感情更加深厚。
小隊到達特靈頓基地後，由亞妮妲透過小隊代號「綠洲」的氣墊偵查車，從外部遠端對企圖破解核子電腦鎖的熊魔靈隊施加反制干擾，其他三人則鎮壓該地區的德姆部隊，被包圍的熊魔靈隊隊長「尼爾萊特」誤以為特靈頓基地並沒有核武，這一切都是聯邦軍的圈套，因此率先帶著阿修塔羅斯搭乘運輸機逃走，正當白色獵犬隊準備追擊時，亞妮妲偵測到一則由吉翁軍發出的高頻影像。
內容是澳洲吉翁軍司令官「瓦爾特•卡帝斯」，對澳洲殘存的全體吉翁軍部隊傳達，即刻執行「月梯」作戰。
