今冬降雨創下 70 多年新低，雨量僅有中位數 17%，新竹頭前溪灌區入春時還因而推行「節水計畫」，雖然清明過後連續補雨，讓北部地區大幅解旱，然而降雨呈現「北多南少」的極端分佈，讓南部水情急轉直下。目前阿公店水庫蓄水率僅有 9.73%，曾文水庫僅剩下 11.2%，白河和蘭潭水庫皆不到 20%。另外，烏山頭及曾文水庫的水位也來到近三年新低點，南部水情極為嚴峻。
由於目前指標性的曾文與烏山頭兩大水庫合計蓄水量已降至兩成以下，水資源調度面臨極大挑戰。媒體報導，農水署為確保農作能在水源受限的情況下維持生產，管理處經審慎評估，決定對台南新營、白河與嘉義、朴子等地區採取「供 9 停 5」的輪灌計畫，直至旱象緩解或另行通知。
不過農田水利署嘉南管理處管理組李建志表示，「供 9 停 5 」與水情無關，而是稻作進入採收期前固定的供水節奏，絕非停灌，「即便水庫全滿，現階段也是『供 9 停 5 』」。
芳榮米廠執行長黃麗琴分析，一期水稻目前正值關鍵的「入漿期」，稻穗趨於飽滿，預計再過 20 日即可採收。由於目前作物生理需求已過高峰，短期停灌 5 天對產量與品質影響不大，預期可順利收成。
台南區農業改良場副研究員張汶肇指出，當前台南地區的文旦與芒果正處於著果及套袋期，此時用水需求相對較低，即便水情吃緊，也不至影響生長。
雖然今年一期作應該能度過難關，但這種「與老天賽跑」的應急模式，顯然無法成為南部農業長期發展的常態。從歷史數據觀之，南部主要水庫的常態性低水位，早已演變成不容忽視的結構性危機。
根據近十年 5 月初的數據分析，南部三大水庫的蓄水表現呈現明顯落差。其中，烏山頭水庫的蓄水量相對穩定，即便集水區未降雨，平均蓄水率仍能維持在六成以上；南化水庫則平均約為三成八。然而，肩負供水重任的曾文水庫，平均蓄水率僅兩成三，水情狀況最為嚴峻。
值得關注的是，曾文水庫作為台灣規模最大的「巨無霸」水庫，其設計總容量達 7.48 億立方公尺，目前的有效容量約 5.08 億立方公尺，滿水位時蓄水面積廣達 17.14 平方公里，規模約等於 2,400 座標準足球場。觀察近年的蓄水走勢圖可以發現，5 月份雖一向是枯水期的水位最低點，但 2026 年的情況顯得更為嚴峻，對比 2024 年或 2025 年同期，水位下降的斜率更為陡峭，且位置明顯處於近年來的低檔區。一旦這座南部最重要的供水核心長年處於入不敷出的「喊渴」狀態，南部的供水韌性便難以樂觀。
面對長期缺水危機，專家多次建言應建立「海綿城市」的韌性，亦即透過滯洪池、生態池，或農田蓄水，讓城市像海綿一樣，能吸水、留水、滲水、淨水，必要時再慢慢把水釋放出來。
對此，水利署副署長王藝峰表示，海綿城市的核心價值在於防洪，透過提升地表滲透率減少逕流，但轉換為民生或工業用水的效益相對有限。他以荷蘭為例，該國推行海綿城市主因是國土低於海平面，須維持高地下水位以防止土壤鹽化，與台灣尋求增加可用水源的目標不盡相同。
至於將農田轉作蓄水池，在台灣實務操作上亦具挑戰。首先，南部蒸散作用旺盛，若未深挖，蓄水極易流失；其次，淺水區經強烈日照易滋生藻類，導致水質惡化，不利後續利用。再者，長期蓄水會拉高周邊農地的地下水位，損及花生等不耐水淹作物的產量。此外，農地在蓄水與耕作間的轉換，涉及農民補償意願及農政單位對產量穩定性的評估，因此目前尚非優先採行的供水對策。
