脂質雙層只能建立一個邊界，
真正讓細胞具備功能的，是嵌在這層邊界中的蛋白質。
如果細胞膜只有脂質雙層，
它只能被動地阻擋或放行少數小分子。 多數對細胞而言真正重要的物質—— 離子、葡萄糖、胺基酸與各種訊號分子—— 都無法自行穿過脂質雙層。 沒有蛋白質，細胞會被自己的邊界限制住， 無法進行有效的物質交換與調控。
整合蛋白質（integral protein；integral membrane protein，IM）
位在脂質雙層之中， 有些甚至橫跨整個細胞膜。 這些蛋白質的存在， 使細胞膜不再只是被動的結構， 而成為能夠選擇與調控的系統。 物質是否進入細胞、進入的時間與數量， 都仰賴整合蛋白質的運作。 細胞能否維持離子濃度、能量供應與內部平衡， 取決於這類蛋白質是否正常發揮功能。
周邊蛋白質（peripheral protein；peripheral membrane protein）
附著於細胞膜的內側或外側表面， 不直接參與物質穿膜， 卻負責連結細胞膜與細胞骨架， 並參與細胞內外的訊息傳遞。 細胞是否能感知刺激、改變形態、啟動反應， 需要這些周邊蛋白質協助完成。
整合蛋白質與周邊蛋白質其中任何一方出現異常，
細胞膜便會失去調控能力， 只剩下一層缺乏功能的外殼。 這種失效不必伴隨破裂或損傷， 只要運輸或訊息傳遞出現問題， 細胞便會逐漸喪失內部平衡，導致功能崩解。
這一段描述的不是蛋白質的分類，
而是細胞如何把邊界轉化為決策與反應的關鍵位置。 細胞是否能感知環境、調整狀態並持續運作， 都集中在細胞膜蛋白的配置與功能之中。
