因為前一篇講到了人工代糖對腸道菌叢改變影響到了代謝，所以這篇就順勢來講目前算新的顯學-腸腦軸。
腸道菌叢影響的腸腦軸機制(gut-brain axis)在近十年開始被神經生物學家重視，在這之前對它的了解，主要還是在消化道癌症(EX:大腸癌)、心血管疾病(EX:次級膽酸)這種腸道黏膜完整性或代謝方面的影響。
後來在一次針對潰瘍性大腸炎(註一)的試驗回顧，發現將健康成人糞便移植到病患腸道後，不但症狀獲得顯著好轉，有些病患的皮膚甚至情緒問題也一併改善，這也讓腸道菌叢的研究目標開始放在腸道以外的作用機制。
這些研究人員發現，消化道菌叢居然會利用腸道的"味覺神經"產生(GABA、serotonin、dopamine)這些神經傳導物質影響大腦，對特定某些食物產生喜愛的感覺，其中dopamine因為會產生渴求、會搜尋環境中特定族群食物而影響更明顯。
腸道微生物既然會讓大腦"偏食"，那改變食物選擇對菌叢影響的速度有多快?結果也讓這些研究者十分驚訝，完全高纖素食者切換完全肉食後，只要短短一天，菌叢種類可以變得完全不一樣，完全推翻"一段時間的飲食"才會影響人體的想像，這也是為什麼前一篇講人工代糖時，WHO會針對"人工代糖"提出特別飲食建議的原因之一。
現在店面、網購 probiotics(益生菌)商品一堆標語很lacal，價格high level，要怎麼吃? 單位(cfu)越高越好?這些問題會跟接下來要講的腸道菌叢在腸腦軸對大腦、情緒、免疫系統、人體肌肉量的影響一起解說，因為會引用一些文獻，所以可能會分幾篇文來講。
(註一):潰瘍性大腸炎是一種自體免疫疾病，持續下去沒改善的話，結果都是大腸癌，差別在癌化的時間快慢。
