勞基法沒有規定雇主一定要發給員工全勤獎金。
怎麼發(包括扣除)？發多少？什麼條件才給？就看勞動契約跟工作規則約定。但是違反相關法令規定是無效。
前行政院勞工委員會76 年 10 月 16 日（76）台勞動字第 4560 號函
扣發全勤獎金及扣發方式，宜由勞資雙方先行協商，明定於團體協約或工作規則中，報請主管機關核備後公開揭示之。
全勤獎金是工資！
前行政院勞工委員會 87年9月14 日（87）台勞動 2 字第 040204 號函
勞基法第2條第3款工資定義，指勞工因工作而獲得之報酬，故全勤獎金若係以勞工出勤狀況而發給，具有因工作而獲得之報酬之性質，則屬工資範疇。
資料來源:高雄市政府勞工局
員工遲到怎麼扣工資呢？
勞動部104 年 11 月 17 日勞動條字第 1040132417 號書函
勞工上班遲到之時間，因未提供勞務，雇主得就遲到時間比例扣發當日工資。雇主如允勞工得以請假方式辦理，尚非不可；其請假之最小單位，得由勞雇雙方自行議定，但雇主不得逕自規定該等遲到時間均應以請假方式處理。
實務1(有請事假)
115年《 勞工請假規則》
第 7 條第2項
勞工為親自照顧家庭成員，除本法或其他法律另有規定者外，得依前項規定請事假，並得擇定以小時為請假單位。
第 9 條第1項第3款
親自照顧家庭成員，不得視為缺勤而影響其全勤獎金。
資料來源:高雄市政府勞工局
實務2(計算式)
資料來源:高雄市政府勞工局
115 年開始施行的《勞工請假規則》全勤獎金扣減只是針對普通傷病假規定。
小結
勞工遲到是該段時間未提供勞務，雇主原則上可以不給付該段時間的工資。
然而，若扣款金額遠超過勞工遲到時間所對應的平均時薪，例如遲到1分鐘卻扣款20元或30元，這可能被主管機關認定為具有「懲罰性」的罰款性質，而非單純的未提供勞務不給薪。此種情況，應屬違反《勞動基準法》第22條第2項工資全額給付原則。
《勞動基準法》第22條第2項：「工資應全額直接給付勞工。」
條文確立工資全額給付原則，除非有法律明文規定或勞雇雙方另有約定且不違反強制規定，雇主不得任意扣減工資。
